Disputó 4 temporadas en San Martín, el club donde más partidos disputaron y donde convirtió más goles convirtió. Recordado por su gol en el ascenso frente a Gimnasia y Esgrima La Plata, Sebastián Penco es uno de los históricos de San Martín, conquistando así los corazones de los hinchas verdinegros.
Por sus goles y su cariño para con el club de Concepción, en las redes sociales le pidieron que vuelva, justo en un momento complicado en lo futbolístico para el club, y el delantero no se quedó callado. "Solo tienen que llamar", respondió, alimentando las ilusiones de todo el Pueblo Viejo. ¿Regresa Motoneta a mitad de año?
Penco actualmente viste la camiseta de Murciélagos Fútbol Club, un equipo de fútbol mexicano.