El técnico español firmó un contrato de tres años hasta 2016 como sucesor del actual entrenador, Jupp Heynckes, cuyo contrato finaliza a fin de temporada.
"Pep Guardiola es uno de los entrenadores más exitosos del mundo. Estamos seguros de que traerá mucho brillo no sólo al Bayern, sino también a todo el fútbol alemán", dijo el presidente de la junta directiva del club bávaro, Karl-Heinz Rummenigge.
Pese a la buena marcha del equipo, cómodo líder en la Liga del fútbol alemán, Heynckes ya había dejado claro que no quería prolongar su contrato. La noticia pone fin a meses de rumores -siempre desmentidos por el Bayern- sobre la llegada de Guardiola.
El técnico estaba libre desde que finalizó en junio su exitosa etapa en el Barcelona, con el que consiguió 14 títulos de 2008 a 2012.